HIV在病毒分類中屬逆轉(zhuǎn)錄病毒科慢病毒屬中的人類免疫缺陷病毒組。以下4個方面的原因使其基因有很高的變異性:
1.高錯誤率的逆轉(zhuǎn)錄酶,復制時不能及時切除錯誤引入的核苷酸,約每個復制循環(huán)中就會發(fā)生一個錯誤使病毒復制時發(fā)生隨機變異。
2.病毒快速的復制,大約每天一個HIV感染者要產(chǎn)生并清除100億個病毒顆粒。
3.宿主的免疫選擇作用,在宿主免疫壓力作用下,使能激發(fā)宿主細胞或體液免疫的基因組的變異高于其他部位,如gp120 V3環(huán)高變區(qū)。
4.不同病毒株DNA之間的基因重組。
HIV基因全長約9.8kb,含有gag、pol、env3個結(jié)構(gòu)基因、2個調(diào)節(jié)基因(tat反式激活因子、rev毒粒蛋白表達調(diào)節(jié)子)和4個輔助基因(nef負調(diào)控因子、vpr病毒r蛋白、vpu病毒u蛋白和vif毒粒感染性因子)。
HIV是一種變異性很強的病毒,各基因的變異程度不同,env基因變異率最高。迄今為止全球流行的HIV根據(jù)血清學反應和病毒核酸序列測定可分為二型,HIV-1型和HIV-2型。在HIV-1和HIV-2二型之間,其核苷酸序列只有40-60%的同源性。在HIV-1型內(nèi),各亞型之間的基因離散率是20%~35%、同一亞型內(nèi)的基因離散率是7%~20%。
目前全球流行的主要是HIV-1,根據(jù)編碼包膜蛋白的env基因和編碼殼蛋白的gag基因序列的同源性,HIV-1型又進一步分為3個組,M組(main即主要組)、O組(outline即外圍組)和N組(new,or non-M,non-O新組或非M非O組),其中M組至今有A,B,C,D,E,F(xiàn),G,H,I,J,K11個亞型。此外,近年來發(fā)現(xiàn)多個流行重組型。O組是1990年從喀麥隆和加蓬分離到的,與M組其他亞型的氨基酸序列只有50%的同源性。N組是最近才從兩名喀麥隆病人分離到的,在系統(tǒng)樹上,既不屬于M組,也不屬于O組的一組新病毒,故稱N組。
HIV-2的生物學特性與HIV-1很相似,但其傳染性較低,引起的艾滋病臨床進展較慢,癥狀也較輕。HIV-2型至今至少有A,B,C,D,E,F(xiàn),G7個亞型。
我國以HIV-1為主要流行株,目前已發(fā)現(xiàn)的有A、B(歐美B)、B’(泰國B)、C、D、E、F和G8個亞型,還有不同流行重組型。1999年以來在部分地區(qū)發(fā)現(xiàn)并證實我國有少數(shù)HIV-2型感染者。但至今尚未發(fā)現(xiàn)有O型及N型的報道。
盡早發(fā)現(xiàn)并鑒定HIV各種亞型,對于流行病學調(diào)查、及時做出診斷、研發(fā)新的診斷試劑、新藥物研制以及疫苗的開發(fā)研究等均具有重要意義。
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